活性炭過濾器是利用顆粒活性炭進一步去除機械過濾器出水中的殘存的余氯、有機物、懸浮物的雜質，為后續的反滲透處理提供良好條件。

活性炭過濾器主要利用含碳量高、分子量大、比表面積大的活性炭有機絮凝體對水中雜質進行物理吸附，達到水質要求，當水流通過活性炭的孔隙時，各種懸浮顆粒、有機物等在范德華力的作用下被吸附在活性炭孔隙中;同時，吸附于活性炭表面的氯(次氯酸)在炭表面發生化學反應，被還原成氯離子，從而有效地去除了氯，確保出水余氯量小于0.1ppm，滿足RO膜的運行條件。隨時間推移活性炭的孔隙內和顆粒之間的截留物逐漸增加，使濾器的前后壓差隨之升高，直至失效。在通常情況下，根據過濾器的前后壓差，利用逆向水流反洗濾料，使大部分吸附于活性炭孔隙中的截留物剝離并被水流帶走，恢復吸附功能;當活性炭達到飽和吸附容量徹底失效時，應對活性炭再生或更換活性炭，以滿足工程要求。